Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms