Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR4Q9NPB9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms