Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE41Q9C0J9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms