Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM5Q9C035 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms