Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GSDMCQ9BYG8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GSDMCQ9BYG8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms