Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms