Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms