Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms