Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms