Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms