Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTKNQ9BST9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms