Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TXNDC17Q9BRA2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms