Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms