Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms