Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms