Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD5Q99666 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms