Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELF4Q99607 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms