Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP88Q99567 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms