Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK2Q96PF2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms