Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDC1Q96MU7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms