Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms