Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms