Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms