Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTC9Q92623 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms