Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms