Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms