Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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