Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARMIL3Q8ND23 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms