Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms