Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C10orf53Q8N6V4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C10orf53Q8N6V4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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