Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms