Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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