Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM47EQ6ZV65 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms