Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms