Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms