Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms