Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPPQ6IPU0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPPQ6IPU0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms