Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD1Q5VV17 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms