Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMPD1Q5SYB0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms