Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms