Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms