Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms