Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FHOD3Q2V2M9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FHOD3Q2V2M9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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