Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms