Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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