Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms