Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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