Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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