Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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