Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms